Mahkamah Konstitusi bersikap hati-hati menanggapi kontroversi soal eksistensi Tap MPR No XI/MPR/1998 tentang Penyelenggaraan Negara yang Bersih dan Bebas Korupsi, Kolusi, dan Nepotisme yang memerintahkan pengusutan korupsi yang dilakukan mantan pejabat, termasuk mantan Presiden Soeharto.